🐌 R Developer, Open Source Computational Immunology

🐌 R Developer, Open Source Computational Immunology

Хештеги: разработчик для open source R пакета, $1500 - 2000, полностью удаленно, вычислительная иммунология для помощи пациентам, молодая биотех-компания из стартап-акселератора при университете Беркли с международными коллаборациями.

Что делать? Помогать в разработке "золотого стандарта" – библиотеки с открытым исходным кодом на R – по анализу иммуногеномных данных в раке и аутоиммунных заболеваниях, а также развитию их клинических применений и первого в мире сообщества по иммунным репертуарам.

Кого ищем? Человек с опытом в биостатистике и разработке на R, а также с желанием развиваться в сторону управления командой биоинформатиков. Огромным плюсом будет опыт в экологии или метагеномике.

Куда расти? Старший разработчик, тимлид команды разработчиков, тимлид команды биоинформатиков, директор по биостатистике. Смежные области, куда можно развиваться: immunogenomics или single-cell биоинформатика, Machine Learning / Deep Learning / Data Science.

Компания. ImmunoMind - биотехнологический стартап из Беркли, Калифорния в сфере вычислительной иммунологии. Наша миссия – объединить иммунологию и ИИ чтобы сделать разработку персонализированных лекарств доступной большему числу фарма и биотех компаний. Мы прошли через топ-5 акселератор Кремниевой Долины Berkeley SkyDeck (1% рейт приема). Наш продукт - платформа для быстрого и сверх-точного анализа данных иммунной системы для разработки лекарств и поиска их побочных эффектов в раке, аутоиммунных и орфанных заболеваниях.

Что нужно делать? Помогать в разработке "золотого стандарта" – библиотеки с открытым исходным кодом на R – для анализа иммуногеномных данных в раке и аутоиммунных заболеваниях, а также развитию их клинических применений. У вас будет возможность поучаствовать в создании первого в мире сообщества по иммунным репертуарам. Необходимо будет добавлять новые методы анализа и визуализации, оптимизировать старые, добавлять поддержку баз данных и больших данных (через dbplyr, sparklyr).

Условия и требования:

Полностью удаленная работа, используем GitHub / Notion / Slack / Zoom для коммуникации и менеджмента.

Большой фокус на индивидуальном подходе к коллегам: регулярные встречи и планирование карьерного развития.

Вилка: $1500 - 2000, опционная программа.

Критичные требования:

• Вы знакомы с dplyr, data.table, ggplot2 или готовы быстро в них разобраться.
• У вас нет проблем с техническим английским, свободно читаете и понимаете о чём идёт речь.
• Опыт и умение разработки чистого, документированного, производительного и покрытого тестами кода.
• Вы ответственны и держите обещания. Если что-то не получается или есть сложности - смело говорите об этом.
• У вас есть мотивация решать сложные задачи в биомедицине.

Опыт разработки R пакетов и работа с dbplyr и sparklyr будет плюсом.

Биоинформатика / биология НЕ критичны! Важно задавать вопросы, если что-то не получается или непонятно.

Задачи:

• Разработка и поддержка библиотеки с открытым исходным кодом, которая обеспечивает фундамент для научных и медицинских исследований ученых со всего мира.
• Имплементация и оптимизация новых алгоритмов для анализа и визуализации по спецификации, предоставленной командой биоинформатиков
• Разработка тестов для новых алгоритмов и методов анализа данных
• Написание документации для библиотеки