Python Developer, High-performance and GPU Computing

🐍 Python Developer, High-performance and GPU Computing

Хештеги: машинное обучение и сверх-производительные вычисления на GPU, $1500 - 3000, полностью удаленно, вычислительная иммунология для помощи пациентам, молодая биотех-компания из стартап-акселератора при университете Беркли с международными коллаборациями.

Кратко:

Что делать? Помогать в разработке ультра-быстрой библиотеки (на GPU и кластерах) для анализа геномных данных в раке, аутоиммунных и орфанных заболеваниях, а также пайплайнов для разработки лекарств и поиска их побочных эффектов.

Кого ищем? Middle+ разработчика на Python с опытом завершенных проектов по машинному обучению или GPU вычислений и желанием развиваться в сторону управления командой HPC Python разработчиков или биоинформатиков.

Куда расти? Старший разработчик, тимлид команды разработчиков, тимлид команды биоинформатиков, директор по высокопроизводительным вычислениям. Смежные области, куда можно развиваться: биоинформатическая разработка, Machine Learning / Deep Learning / Data Science, single-cell биоинформатика.

Компания. ImmunoMind - биотехнологический стартап из Беркли, Калифорния в сфере вычислительной иммунологии. Наша миссия – объединить иммунологию и ИИ чтобы сделать разработку персонализированных лекарств доступной большему числу фарма и биотех компаний. Мы прошли через топ-5 акселератор Кремниевой Долины Berkeley SkyDeck (1% рейт приема). Наш продукт - платформа для быстрого и сверх-точного анализа данных иммунной системы для разработки лекарств и поиска их побочных эффектов в раке, аутоиммунных и орфанных заболеваниях.

Что нужно делать? Важная часть бэкэнда нашей платформы – ультра-быстрая библиотека (на GPU и кластерах) для анализа геномных данных в раке, аутоиммунных и орфанных заболеваниях. Мы ищем разработчика для этой библиотеки, а также пайплайнов для разработки лекарств и поиска их побочных эффектов – необходимо будет добавлять новые методы анализа и визуализации, а также оптимизировать вычисления на GPU, multi-GPU и кластерах. Стэк: Cuda, CuPy, RAPIDS.ai, стандартный Data Science стэк (pandas, etc.), в будущем Spark.

Условия и требования:

• Полностью удаленная работа, используем GitHub / Notion / Slack / Zoom для коммуникации и менеджмента.
• Большой фокус на индивидуальном подходе к коллегам: регулярные встречи и планирование карьерного развития.
• Вилка: $1500 - 3000, опционная программа.
• Критичные требования:
  • Уверенное владение стандартным стеком Python для Data Science (sklearn, pandas, numpy, scipy, etc.)
  • Опыт и умение разработки чистого, документированного, производительного и покрытого тестами кода.
  • Опыт завершенных проектов по машинному обучению или GPU вычислений.
  • Вы ответственны и держите обещания. Если что-то не получается или есть сложности - смело говорите об этом.
  • У вас есть мотивация решать сложные задачи в биомедицине.
• Опыт оптимизации вычислений на GPU (cuda), RAPIDS.ai и CuPy будет плюсом.
• Биоинформатика / биология НЕ критичны! Важно задавать вопросы, если что-то не получается или непонятно.

Задачи:

• Разработка ультра-быстрой библиотеки для анализа геномных данных с использованием Cuda
• Имплементация и оптимизация новых алгоритмов для анализа и визуализации по спецификации, предоставленной командой биоинформатиков
• Разработка тестов для новых алгоритмов и методов анализа данных
• Написание документации для библиотеки